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################CONVERTITORE DI COORDINATE HG19-NG###################
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Il programma consente di convertire le coordinate genomiche (Hg19)
inserite dall'utente in coordinate NG o viceversa.

Gli NG attualmente disponibili sono:
-ADAR (NG_011844.1);
-ATP1A2 (NG_008014.1);
-ATP13A2 (NG_009054.1);
-CACNA1A (NG_011569.1);
-COL4A1 (NG_011544.2);
-COL4A2 (NG_032137.1);
-EIF4G1 (NG_016850.1);
-LRRK2 (NG_011709.1);
-PARK2 (NG_008289.1);
-PARK7 (NG_008271.1);
-PINK1 (NG_008164.1);
-RNASEH2A (NG_012662.1);
-RNASEH2B (NG_009055.1);
-RNASEH2C (NG_008976.2);
-SAMHD1 (NG_017059.1);
-SNCA (NG_011851.1);
-TREX1 (NG_009820.1);
-UCHL1 (NG_012931.1);
-VPS35 (NG_029970.1).

# Installazione
- Copiare "convertitore-32bit_pkg.exe" sul Desktop del pc e fare doppio click 
  sull'icona.Inizierà l'installazione di Matlab Compiler Runtime R2012a;
- seguire la procedura guidata.

Al termine della procedura, compariranno 3 nuove icone: MCRInstaller, readme.txt
e convertitore-32bit.exe.
I file MCRInstaller e readme.txt possono essere rimossi dal Desktop.

Per utilizzare il programma occorre cliccare su "convertitore.exe".

# Modalità di utilizzo
Nel primo riquadro, l'utente deve selezionare,tramite menù a tendina,
la tipologia di input (Hg19 oppure uno specifico NG) ed inserire 
le coordinate singole o dell'intervallo desiderato (nella forma start-end) 
nel formato indicato dalla legenda. 
Al click del bottone "Converti" compare il risultato ottenuto
nel secondo riquadro. 

# Funzionalità
Il programma restituisce le coordinate convertite ed il loro 
riferimento (Hg19 o NG), una nota che indica se il gene interessato 
è di tipo reverse ed informazioni relative alla posizione 
esonica/intronica dell'intervallo inserito.
Nel caso in cui venga specificata una singola coordinata, 
il programma indica in quale esone o tra quali esoni essa si trova; 
se, invece, si inserisce un intervallo di coordinate, vengono 
visualizzati gli esoni inclusi ed il numero delle basi degli introni 
o degli esoni parzialmente compresi. 
Qualora l'intervallo genomico da convertire sia al di fuori del range 
NG corrispondente (per un massimo di 200 basi), viene automaticamente 
corretto.
E' prevista anche la correzione (selettiva) nel caso in cui l'utente
inserisca erroneamente la coordinata di end prima di quella di start:
compare una finestra di dialogo che consente di scegliere se invertire
le coordinate oppure se reinserirle nuovamente.

# Informazioni
convertitore-32bit.exe comprende l'installazione di "MATLAB Compiler Runtime 
7.17 (32-bit)" e di "Microsoft Visual C++ 2008 Redistributable" (10,1 MB).
La presente versione del programma è a 32 bit.